Ciężki ostry zespół oddechowy, koronawirus-2 (SARS-CoV-2) i wirusy grypy mogą stanowić ogromne wyzwanie dla naszego systemu opieki zdrowotnej. Oceniliśmy wydajność zestawu PowerChek SARS-CoV-2, Influenza A & B Multiplex Real-time PCR Kit (PowerChek; Kogene Biotech, Seul, Korea) w porównaniu z panelami oddechowymi BioFire 2 i 2.1 (RP2 i RP2.1; bioMérieux, Marcy l’Étoile, Francja), przy użyciu 147 wymazów z nosogardzieli.
Granica wykrywalności (LOD) testu PowerChek została określona przy użyciu standardów SARS-CoV-2, wirusa grypy A i B RNA. Wartości LOD testu PowerChek dla SARS-CoV-2 i grypy A i B wynosiły odpowiednio 1,12, 1,24 i 0,61 kopii/μl. Dodatnie i ujemne zgodności procentowe testu PowerChek w porównaniu z RP2 i RP2.1 wyniosły 97,5% (39/40) i 100% (107/107) dla SARS-CoV-2; 100% (39/39) i 100% (108/108) na grypę A; oraz 100% (35/35) i 100% (112/112) odpowiednio dla grypy B. Wydajność testu PowerChek była porównywalna z wydajnością RP2 i RP2.1 w wykrywaniu SARS-CoV-2 oraz grypy A i B, co sugeruje jego zastosowanie w diagnozowaniu infekcji SARS-CoV-2 i grypy.
Multipleksowe testy amplifikacji kwasów nukleinowych, które jednocześnie wykrywają wiele patogenów układu oddechowego w jednej próbce wymazu z nosogardzieli (NPS), są szeroko stosowane w szybkiej diagnostyce klinicznej.
- Oceniliśmy panel oddechowy Allplex (RP) 1, 2, 3 oraz test BioFire FilmArray RP pod kątem wykrywania patogenów układu oddechowego z próbek NPS. Ogółem uwzględniono 181 próbek NPS uzyskanych od pacjentów z podejrzeniem infekcji dróg oddechowych w okresie pozagrypowym (sierpień-grudzień 2019 r.).
- Allplex RP 1, 2 i 3 wykrył 154 próbki pozytywne dla wirusów układu oddechowego, podczas gdy BioFire FilmArray wykrył wirusy w 98 próbkach.
- Współinfekcję dwoma lub większą liczbą wirusów wykryto w 41 i 17 próbkach NPS odpowiednio przez Allplex RP i BioFire FilmArray RP. W przypadku adenowirusów Allplex RP 1 wykrył 31 próbek, w porównaniu z 34 przez BioFire FilmArray. W sumie 64 próbki NPS dały wynik pozytywny dla ludzkiego enterowirusa (HEV) i ludzkiego rinowirusa (HRV) na Allplex RP, w przeciwieństwie do 39 HEV/HRV na BioFire FilmArray.
- Wskaźniki wykrywalności wirusa paragrypy (PIV-1-4) różniły się w obu systemach. Najbardziej rozbieżne wyniki zaobserwowano dla próbek NPS z wysokimi wartościami progowymi cyklu uzyskanymi przez Allplex RP. Badanie to wykazało zgodne działanie Allplex RP 1, 2, 3 i BioFire FilmArray RP w jednoczesnym wykrywaniu wielu wirusów układu oddechowego.
- Zakaźna biegunka jest globalnym problemem zdrowotnym w pediatrii; dlatego kluczowe znaczenie ma szybkie i dokładne wykrywanie enteropatogenów. Oceniliśmy panel BioFire FilmArray Gastrointestinal (GI) za pomocą porównawczych testów laboratoryjnych.
Prospektywnie pobrano i przebadano próbki kału od pacjentów pediatrycznych z biegunką.
Jako metodę porównawczą dla bakterii zbadano hodowlę, konwencjonalną reakcję PCR dla biegunki E. coli oraz test Allplex GI-Bacteria(I). Do analizy rozbieżności zastosowano panel bakteryjny dojelitowy BD MAX. Jako metodę porównawczą dla wirusa zastosowano panel BD MAX Enteric Virus Panel i immunochromatografię, a do analizy rozbieżności zastosowano test Allplex GI-Virus Assay.
„Prawdziwie dodatni” został zdefiniowany jako dodatni wynik hodowli i/lub dodatni wynik z więcej niż dwóch testów molekularnych. Spośród 184 przebadanych próbek kału 93 (50,5%) było rzeczywiście pozytywnych dla 128 patogenów, a 31 (16,9%) było pozytywnych dla wielu patogenów. Panel BioFire GI wykrył 123 patogeny w 90 próbkach. Panel BioFire GI wykazał czułość 100% dla 12 celów i swoistość >95% dla 16 celów. Ogólny odsetek dodatnich wyników i odsetek wielu patogenów wśród pacjentów w grupie bez chorób podstawowych był istotnie wyższy niż w grupie z chorobą hematologiczną (57,0% vs. 28,6% ( p = 0,001) i 20,4% vs. 4,8% ( p = 0,02)). Panel BioFire GI zapewnia kompleksowe wyniki w ciągu 2 godzin i może być przydatny do szybkiej identyfikacji enteropatogenów
Wdrożyliśmy BioFireFilmArray Meningitis/Encephalitis Panel (MEP) ze wskazówkami dotyczącymi stosowania w oparciu o wiek pacjenta, liczbę białych krwinek (WBC) w płynie mózgowo-rdzeniowym (CSF) i stan układu odpornościowego.
Oceniono wyniki MEP w okresie 2 lat (od 1.01.2017 do 31.12.18) i oceniono znaczenie kliniczne pozytywnych wyników MEP u pacjentów z WBC ≤10 w płynie mózgowo-rdzeniowym. Ogółem 12% (51/453) MEP było dodatnich, a 4/184 (2%) dodatnich w przypadku osób z obniżoną odpornością (bez IC) z ≤ 10 WBCs w płynie mózgowo-rdzeniowym.
Wśród pozytywnych wyników u pacjentów bez IC z ≤10 krwinkami białych krwinek w płynie mózgowo-rdzeniowym żaden nie został oceniony jako istotny klinicznie. Cztery z 6 wyników u pacjentów z obniżoną odpornością i ≤10 leukocytów w płynie mózgowo-rdzeniowym były istotne klinicznie. Zbędne testy były powszechne, a przestrzeganie wytycznych mogłoby bezpiecznie zmniejszyć zużycie przez posłów do Parlamentu Europejskiego o 41% oszczędności > 56 000 USD. Stosowanie się do wytycznych było słabe i można bezpiecznie uniknąć stosowania MEP u dorosłych bez IC z <10 CSF WBC, ale klinicznie istotne wyniki wystąpiły u pacjentów z IC z niską liczbą krwinek białych w płynie mózgowo-rdzeniowym. Wsparcie decyzji klinicznych może ograniczyć niepotrzebne testy i skutkować znacznymi oszczędnościami kosztów
Potencjalny współkrążenie SARS-CoV-2, grypy i wirusa RSV może stanowić bezprecedensowe wyzwanie dla systemów opieki zdrowotnej na całym świecie. Tutaj porównaliśmy wydajność zestawu PowerChek SARS-CoV-2, grypy A&B, RSV Multiplex Real-time PCR Kit (PowerChek) do jednoczesnego wykrywania SARS-CoV-2, grypy A i B oraz syncytialnego wirusa oddechowego z wydajnością Panel oddechowy BioFire 2.1 (RP2.1) wykorzystujący 175 próbek wymazów z nosogardzieli (NPS).
Custom development of ELISAs for other species or antibody isotypes not listed in the catalog. Custom testing of samples for IgG/IgM/IgA or total (IgG+IgM+IgA) |
|||
000-CUS | Alpha Diagnostics | Custom | Ask for price |
Alpha-bungarotoxin, CF405s |
|||
00002 | Cusabio | 500uG | 594 EUR |
Alpha-bungarotoxin, CF405s |
|||
00002-100ug | Biotium | 100uG | 193.2 EUR |
Alpha-bungarotoxin, CF680r |
|||
9-00003 | Biotium |
|
|
Alpha-bungarotoxin, CF680r |
|||
9-00003 | Biotium |
|
|
Alpha-bungarotoxin, CF640r |
|||
9-00004 | Biotium |
|
|
Alpha-bungarotoxin, CF640r |
|||
9-00004 | Biotium |
|
|
Alpha-bungarotoxin, CF488a |
|||
9-00005 | Biotium |
|
|
Alpha-bungarotoxin CF488a |
|||
9-00005 | Biotium |
|
|
Alpha-bungarotoxin, CF568 |
|||
9-00006 | Biotium |
|
|
Alpha-bungarotoxin, CF568 |
|||
9-00006 | Biotium |
|
|
Alpha-bungarotoxin, CF594 |
|||
9-00007 | Biotium |
|
|
Alpha-bungarotoxin CF594 |
|||
9-00007 | Biotium |
|
|
Alpha-bungarotoxin, CF633 |
|||
9-00009 | Biotium |
|
|
Alpha-bungarotoxin, CF633 |
|||
9-00009 | Biotium |
|
|
Alpha-bungarotoxin |
|||
00010-1 | Biotium | 1MG | 201.6 EUR |
Fluorescein-Alpha-bungarotoxin |
|||
00011 | Biotium | 500uG | 440.4 EUR |
Tetramethylrhodamine-Alpha-bungarotoxin |
|||
00012 | Biotium | 500uG | 459.6 EUR |
Fluorescein-alpha-bungarotoxin: (10x50ug) |
|||
00013 | Biotium | 10ST | 500.4 EUR |
Tetramethylrhodamine-alpha-bungarotoxin: (10x50ug) |
|||
00014 | Biotium | 10ST | 559.2 EUR |
Sulforhodamine 101-a-bungarotoxin (Texas Red--a-bungarotoxin): (500ug) |
|||
00015 | Biotium | 500uG | 559.2 EUR |
Sulforhodamine 101-a-bungarotoxin (Texas Red--a-bungarotoxin): (10x50ug) |
|||
00016 | Biotium | 10ST | 627.6 EUR |
Biotin-xx-a-bungarotoxin |
|||
00017 | Biotium | 500uG | 519.6 EUR |
Alpha-Bungarotoxin, CF555 conjugate |
|||
9-00018 | Biotium |
|
|
Alpha-Bungarotoxin, CF555 conjugate |
|||
9-00018 | Biotium |
|
|
Biotin-cAMP, diisopropylethylammonium salt: |
|||
00020 | Biotium | 1MG | 376.8 EUR |
Biotin-cAMP, diisopropylethylammonium salt: (20x50ug) |
|||
00020-1 | Biotium | 20ST | 501.6 EUR |
Biotin-cGMP, diisopropylethylammonium salt: |
|||
00021 | Biotium | 1MG | 412.8 EUR |
Biotin-cGMP, diisopropylethylammonium salt: (20x50ug) |
|||
00021-1 | Biotium | 20ST | 537.6 EUR |
Cyanine 644-cAMP: |
|||
00022 | Biotium | 1MG | 589.2 EUR |
Cyanine 644-cAMP: (20x50ug) |
|||
00022-1 | Biotium | 20ST | 750 EUR |
Fluorescein Methotrexate, triammonium salt: |
|||
00023 | Biotium | 1MG | 337.2 EUR |
Staurosporine |
|||
00025 | Biotium | 100uG | 166.8 EUR |
Alpha-bungarotoxin, CF543 |
|||
00026 | Biotium | 500uG | 592.8 EUR |
Rhodamine phalloidin 300u |
|||
00027 | Biotium | 300 | 414 EUR |
Biotin-xx-phalloidin |
|||
00028 | Biotium | 100U | 513.6 EUR |
Fluorescein-phalloidin |
|||
00030 | Biotium | 300U | 414 EUR |
Rhodamine 110 phalloidin |
|||
00032 | Biotium | 300ST | 414 EUR |
Sulforhodamine 101 (Texas-Red) Phalloidin |
|||
00033 | Biotium | 300EU | 414 EUR |
Phalloidin, CF405M |
|||
00034 | Biotium | 300U | 530.4 EUR |
Phalloidin, CF405M |
|||
00034-T | Biotium | 50U | 159.6 EUR |
CF488A-cAMP |
|||
00036 | Biotium | 100ug | 206.4 EUR |
CF640R-cAMP |
|||
00037 | Biotium | 100ug | 206.4 EUR |
Phalloidin, CF555 |
|||
00040 | Biotium | 300U | 530.4 EUR |
Phalloidin, CF555 |
|||
00040-T | Biotium | 50U | 159.6 EUR |
Phalloidin, CF647 |
|||
00041 | Biotium | 300U | 530.4 EUR |
Phalloidin, CF647 |
|||
00041-T | Biotium | 50U | 159.6 EUR |
Phalloidin, CF488A |
|||
00042 | Biotium | 300U | 530.4 EUR |
Phalloidin, CF488A |
|||
00042-T | Biotium | 50U | 159.6 EUR |
Phalloidin, CF543 |
|||
00043 | Biotium | 300U | 530.4 EUR |
Phalloidin, CF543 |
|||
00043-T | Biotium | 50U | 159.6 EUR |
Phalloidin, CF568 |
|||
00044 | Biotium | 300U | 530.4 EUR |
Phalloidin, CF568 |
|||
00044-T | Biotium | 50U | 159.6 EUR |
Phalloidin, CF594 |
|||
00045 | Biotium | 300U | 530.4 EUR |
Phalloidin, CF594 |
|||
00045-T | Biotium | 50U | 159.6 EUR |
Phalloidin, CF633 |
|||
00046 | Biotium | 300U | 530.4 EUR |
Phalloidin, CF633 |
|||
00046-T | Biotium | 50U | 159.6 EUR |
Phalloidin, CF660R |
|||
00047 | Biotium | 300U | 530.4 EUR |
Phalloidin, CF660R |
|||
00047-T | Biotium | 50U | 159.6 EUR |
Phalloidin, CF680R |
|||
00048 | Biotium | 300U | 559.2 EUR |
Phalloidin, CF680R |
|||
00048-T | Biotium | 50U | 159.6 EUR |
Phalloidin, CF350 |
|||
00049 | Biotium | 300U | 530.4 EUR |
Phalloidin, CF350 |
|||
00049-T | Biotium | 50U | 159.6 EUR |
Phalloidin, CF640R |
|||
00050 | Biotium | 300U | 530.4 EUR |
Phalloidin, CF640R |
|||
00050-T | Biotium | 50U | 159.6 EUR |
Phalloidin, CF532 |
|||
00051 | Biotium | 300U | 530.4 EUR |
Phalloidin, CF532 |
|||
00051-T | Biotium | 50U | 159.6 EUR |
Phalloidin, CF660C |
|||
00052 | Biotium | 300U | 530.4 EUR |
Phalloidin, CF660C |
|||
00052-T | Biotium | 50U | 159.6 EUR |
Phalloidin, CF680 |
|||
00053 | Biotium | 300U | 559.2 EUR |
Dodatnia zgodność procentowa i ujemna zgodność procentowa testu PowerChek w porównaniu z RP2.1 były następujące: 100% (40/40) i 100% (135/135) dla SARS-CoV-2; 100% (39/39) i 100% (136/136) na grypę A; 100% (35/35) i 100% (140/140) na grypę B; i 93,1% (27/29) i 100% (146/146) odpowiednio dla RSV. Limit wykrywalności (LOD) uzyskano za pomocą standardów RNA dla każdego wirusa, a wartości LOD testu PowerChek dla SARS-CoV-2, grypy A i B oraz RSV wynosiły 0,36, 1,24, 0,09 i 0,63 kopii/μl , odpowiednio. Nasze wyniki pokazują, że test PowerChek jest czuły i dokładny w wykrywaniu SARS-CoV-2, grypy A i B oraz RSV, co sugeruje, że test ten może być cennym narzędziem diagnostycznym, gdy SARS-CoV-2, grypa i RSV są w obiegu.